Det blir två svenskor i eftermiddagens semifinal då också Sara Junevik avancerade med elfte tid på 26,04.
Sjöström har aldrig tidigare väntat så länge på sin första individuella start i ett mästerskap.
Hon simmade i lagkappen första dagen, men har – efter att ha valt bort 100 meter fritt – väntat i fem dagar efter att få börja tävla individuellt.
– Det har varit mycket ledig tid de här dagarna. I vanliga fall är jag rätt trött den sjätte dagen i ett mästerskap. Det kändes skönt att ha de här dagarna, naturligtvis såg jag semifinalen (på 100 meter fritt) i går och kände mig taggad att simma, säger Sjöström.
"Studsade på ytan"
Där fick hon se kompisen Michelle Coleman, som fick Sjöströms plats på 100 meter fritt, ta sig till karriärens första VM-final i långbana. Den avgörs i eftermiddag.
– Fantastiskt, helt underbart. Hon bara studsade på ytan, det var kul att se, säger Sjöström.
50 meter fjäril och helgens 50 meter fritt är Sarah Sjöströms enda individuella grenar i VM i Fukuoka.
– Jag är ändå väldigt glad att jag tog beslutet att fokusera på 50-metersdistanserna, speciellt eftersom min träning har varit fokuserad på de grenarna. Jag kände mig väldigt stark, säger Sjöström.
Hennes 25,04 är den tangerat näst snabbaste tiden hon har gjort på distansen i år.
En imponerande snabb insats i ett försökslopp.
Sjöström var 29 hundradelar före tvåan Zhang Yufei, Kina.
– Det är riktigt kul att man så enkelt kunde starta med 25,0, säger hon.
Sjöström är på jakt efter att bli historiens medaljrikaste simmare i långbane-VM. Tar hon två medaljer passerar hon amerikanske legendaren Michael Phelps som har simmat hem 20 individuella VM-medaljer.
Sjöström står på 19.
Missade målgången
Sara Junevik simmade exakt en sekund långsammare, men missade målgången.
– Nej, den var inte riktigt där. Jag hade väldigt mycket fokus på första 25 meterna och göra det avslappnat. Med lite mer fart i kväll tror jag allt kommer att sitta, säger Junevik.
För de svenska herrarna fortsätter ett dystert VM där formen lyser med sin frånvaro.
Björn Seeliger hade 22,30 på 50 meter fritt – nästan sex tiondelar över sitt personliga rekord.
Det räckte bara till 31:a plats och det saknades 25 hundradelar för avancemang.
Oskar Hoff hade det ännu tyngre på 100 meter fjäril och hans 53,97 var 2,2 sekunder från avancemang. Han slutade på 45:e plats.