"Jens har tillsammans med teamet runt sig värderat bästa vägen till OS, och just nu bedöms Tour de Ski inte vara det mest fördelaktiga”, säger Jan Wall, medicinskt ansvarig för längdlandslaget, i en kommentar.
Även Anton Persson stryker sig från skidtouren.
"Anton Person har en lättare övre luftvägsinfektion", säger Wall.
Gustav Eriksson ersätter i den svenska tourtruppen.
Burman bröt säsongspremiären i Gällivare med ryggsmärtor och avstod sedan från världscupens inledande tävlingar. Han gjorde säsongsdebut i Davos den 12 december och blev 42:a i 15-kilometersloppet. Därefter har han bara kört ett mindre lopp i Idre.
Tour de Ski inleds i Lenzerheide i Schweiz den 28 december och avslutas i Val di Fiemme, Italien, den 4 januari.
Sveriges trupp till Tour de Ski består därmed av Gustaf Berglund, Viktor Brännmark, Calle Halfvarsson, Eric Rosjö och Oskar Svensson på herrsidan.
På damsidan tävlar Ebba Andersson, Anna Dyvik, Johanna Hagström, Charlotte Kalla, Frida Karlsson, Louise Lindström och Moa Lundgren.