Andersson skulle ha gjort världscupdebut i dag i Ruhpolding. Men en förkylning stoppar 19-åringen.
"Hon är isolerad från resten av laget och kommer troligen att resa hem i dag eller i morgon", skriver landslagstränaren Johannes Lukas i ett meddelande.
Andersson tog guld och brons i JVM i fjol och skulle få chansen att för första gången få köra i världscupen den här veckan i Tyskland.
Även Linn Persson avstår dagens lopp.
"Hon hade en bra känsla efter träningen igår, men under morgonen kände hon sig åter lite snuvig. Det är mer en säkerhetsåtgärd", skriver Lukas om Persson.
Persson har varit isolerad från truppen sedan i söndags och får vara kvar i eget boende ytterligare några dagar.
Damernas distanslopp startar klockan 14.10.