Norrmannen Tarjei Bø vann efter att bara skjutit en bom i loppet. Han vann med 13,5 sekunder före lillebror Johannes Tingnes Bø (två bom). Sprintsegraren Simon Desthieux, Frankrike, kom trea efter två bom.
Samuelsson var trots bommarna inte särskilt besviken.
– Det är lite surt, men ingen katastrof. Det blir lite mellanmjölk av allting och det är lite synd, säger han till TT.
– Men med tanke på fyra bom är en tolfte plats ganska bra.
Han har inget svar på varför det blev så många bom.
– Fokus kanske inte var riktigt med mig, jag kände mig lite mer stressad på skjutvallen idag. Men jag tror att det bara var en lite sämre dag.
Jesper Nelin åkte upp sig från 32:a plats i sprinten till 18:e plats i jaktstarten. Martin Ponsiluoma tappade däremot från 20:e till 34:e plats.