Kvällens triumf kom efter en omstart sedan Jason Doyle, Australien, uteslutits i finalen. Svensken var snabbast i kampen om titeln och VM-poängen med tvåan Jack Holder, Australien, och trean Bartosz Zmarzlik, Polen.
För segern fick Lindgren 20 poäng och står som Zmarzlik på 36 poäng efter de inledande två deltävlingarna.
Kim Nilsson kom på 15:e plats och fick två VM-poäng.
Den första deltävlingen avgjordes i Kroatien.
Härnäst fortsätter VM-serien i Prag den 3 juni. I juli är det dags för VM-deltävling i Målilla.