I finalen väntar norskt motstånd i form av Casper Ruud för Djokovic.
Den 36-årige serben tog hem första set med 6–3 innan världsettan Alcaraz, 20, svarade och vann andra med 7–5.
I början av tredje set ändrades förutsättningarna rejält.
Alcaraz grimaserade illa och tog sig för sin högra vad, uppåt knäet. Djokovic gick då fram för att stämma av läget med spanjoren innan matchen fick ett kort avbrott för att sedan återupptas.
Alcaraz fortsatte spela det tredje setet, klart plågad av vad som visade sig vara kramp, ett set som serben enkelt tog hem med siffrorna 6–1.
Den stora frågan inför fjärde set var om spanjoren skulle kunna fullfölja matchen eller inte.
Det kunde han.
"Stor respekt"
Alcaraz inledde det fjärde setet piggt, men Djokovic tog hem det första gamet och därefter rullade det på.
Serben vann till slut fjärde set med 6–1 och matchen med 3–1 i set.
– Det sista du vill ha är kramp och fysiska problem. Jag tycker synd om honom och jag hoppas att han kan återhämta sig och vara tillbaka snart. Det är tufft för honom att veta om han ska spela klart matchen eller inte, men jag har stor respekt för honom, för hans kämpaglöd och för att han spelade vidare, säger Djokovic i segerintervjun.
23 grand slam-titlar?
Djokovic fortsätter:
– Jag sade till honom vid nätet att han vet hur ung han är, hur mycket tid han har framför sig. Han kommer att vinna den här turneringen många gånger. Han är en fantastisk spelare.
Alcaraz själv:
– Hela min kropp krampade, jag har aldrig känt sådana spänningar förut, säger spanjoren enligt AFP där han även hyllar serben.
– Novak är en legend i vår sport.
I finalen väntar norrmannen Casper Ruud som slog ut tysken Alexander Zverev med 3–0 i set i den andra semifinalen. Vinner Djokovic den har han 23 grand slam-titlar, fler än någon annan.
– Jag är otroligt stolt över att ta mig till ännu en final, säger Djokovic.
