Anledningen är en muskelskada, meddelar det brittiska laget.
Däremot ska han fortsätta spela dubbelturneringen tillsammans med Joe Salisbury, de vann sin öppningsmatch under lördagen.
"Jag är verkligen besviken över att jag måste dra mig ur, men det medicinska teamet har rått mig att inte spela i båda turneringarna, så jag har tagit det tuffa beslutet att dra mig ur singelturneringen och fokusera på dubbelspelet tillsammans med Joe", säger Murray i ett uttalande.
Murray, 34, tog OS-guld i herrsingel både i London 2012 och senast i Rio 2016. Senaste åren har han haft stora skadeproblem.