Medvedev misslyckades därmed med att ta revansch efter den hårda finalförlusten i Australian Open i januari, där den 35-årige spanjoren stod för en makalös vändning och vann i fem set efter att ha förlorat de två första. Vinsten innebar hans 21:a grand slam-titel, ett nytt historiskt rekord på herrsidan.
Drabbningen i Mexiko var dock tuffare än vad siffrorna ger vid handen
Efter att ha brutit ryssen tidigt i andra set stötte Nadal på problem i det fjärde gemet, där han tvingades rädda fyra breakbollar.
I sjätte gemet pressade Medvedev på nytt, men lyckades i slutändan inte få med sig någon av sina totalt sju breakchanser.
– Det andra setet var väldigt känslosamt, säger Nadal.
– Daniil spelade väldigt aggressivt, stoppbollar, vinnare. Det var ett väldigt svårt set.
Trots en ledning med 40-0 förlorade Medevev matchen i eget gem när han servade för att hålla sig kvar i matchen vid ställningen 5-3. Det finns dock skäl till glädje för 26-åringen – på måndag tar han nämligen över förstaplatsen från Novak Djokovic efter serbens förlust i Dubai i går.
Nadal ställs i finalen i Acapulco mot britten Cameron Norrie, som enkelt vann sin semifinal mot världsfyran Stefanos Tsitsipas, 6–4, 6–4.