Enligt det internationella triathlonförbundet, World Triathlon, inträffade dödsfallet efter en trafikolycka under ett träningsläger i Frankrike.
Miyazaki uppges ha cyklat när hon blev påkörd av en bil. Hon befann sig i Frankrike för att förbereda sig inför OS i Paris 2024.
25-årigen tävlade i VM i spanska Pontevedra i förra veckan.
I ett uttalande skickar World Triathlon och Japans triathlonförbund "sina djupaste kondoleanser" till Miyazakis familj och vänner.